Virus Shamonda-like: un nuevo Orthobunyavirus emergente en Europa. Epidemiología, clínica y diagnóstico laboratorial

El virus Shamonda-like es un Orthobunyavirus del serogrupo Simbu recientemente identificado en Europa, cuya distribución, repercusión clínica y significado epidemiológico todavía son poco conocidos. El objetivo de este trabajo fue describir las primeras detecciones laboratoriales de virus Shamonda-like en España y revisar sus principales implicaciones epidemiológicas, clínicas y diagnósticas. Se analizaron muestras de sangre con EDTA o suero procedente de bovinos de aptitud lechera de explotaciones de Andalucía, remitidas a Laboklin España durante la segunda semana de septiembre de 2026. La extracción automatizada de ácidos nucleicos se realizó mediante el sistema MagNA Pure 96 y la detección molecular mediante el kit comercial AdiaLyo SHLV en un equipo LightCycler^® 96. Se consideraron positivas las muestras con valores de Cq inferiores a 35. Se identificaron ocho muestras positivas, todas procedentes de bovinos con sintomatología similar, caracterizada principalmente por fiebre, diarrea y descenso de la producción lechera. Los valores de Cq oscilaron entre 21.3 y 34.9, con una media de 29.9 y una mediana de 29.0. Estos resultados documentan la presencia de virus Shamonda-like en España y amplían su distribución conocida en Europa. La detección molecular constituye una herramienta diagnóstica útil, aunque son necesarios estudios adicionales para determinar su distribución, patogenicidad, importancia reproductiva y repercusión productiva.

Los Orthobunyavirus constituyen un amplio grupo de virus ARN de cadena sencilla y sentido negativo, incluidos actualmente en la familia Peribunyaviridae. Su genoma está formado por tres segmentos, denominados L, M y S, que codifican, respectivamente, la ARN-polimerasa dependiente de ARN, las glucoproteínas de la envoltura y las proteínas nucleocapsídica y no estructural. Muchos Orthobunyavirus presentan un ciclo de transmisión asociado a artrópodos hematófagos y algunos poseen una importante repercusión en sanidad animal por su capacidad para producir enfermedad en rumiantes¹^,².

Dentro del género Orthobunyavirus se encuentra el denominado serogrupo Simbu, un grupo de virus transmitidos principalmente por dípteros hematófagos del género Culicoides. Entre sus miembros se incluyen virus de importancia veterinaria como Schmallenberg (SBV), Akabane (AKAV) y Shamonda (SHAV)¹^,². Estos agentes pueden presentar tropismo por el tejido fetal y, dependiendo del virus y del momento de la infección durante la gestación, producir abortos, mortalidad fetal o alteraciones congénitas. El virus Akabane constituye un ejemplo bien caracterizado de este fenómeno y se ha asociado a artrogriposis, hidranencefalia y otras alteraciones neuromusculares en rumiantes.²

El virus Shamonda fue identificado inicialmente en Nigeria en la década de 1960 a partir de bovinos y posteriormente se detectó en mosquitos del género Culicoides. Décadas después, el virus fue nuevamente aislado en Japón a partir de bovinos centinela y Culicoides, confirmándose su circulación en el país.³ Estudios posteriores demostraron su asociación con alteraciones congénitas en terneros, incluyendo artrogriposis y lesiones del sistema nervioso central, lo que situó a SHAV entre los Orthobunyavirus con potencial teratógeno para los rumiantes.⁴

La aparición de SHAV en Europa debe diferenciarse de la introducción del virus Schmallenberg. El SBV fue identificado por primera vez en Europa en 2011 y produjo cuadros agudos caracterizados principalmente por fiebre, diarrea y disminución de la producción láctea, además de alteraciones reproductivas y congénitas en fetos y neonatos.⁵ Por su parte, el virus Akabane presenta una distribución principalmente en África, Asia, Oriente Medio y Australia y se caracteriza especialmente por su capacidad teratógena.² Aunque los tres virus pertenecen al serogrupo Simbu y comparten determinadas características epidemiológicas, presentan diferencias genéticas y antigénicas que hacen necesario establecer un diagnóstico diferencial específico.

Durante el verano de 2026 se identificó en Europa un nuevo linaje de Orthobunyavirus relacionado estrechamente con el virus Shamonda. Las primeras detecciones se produjeron en Suiza, Francia y Alemania y posteriormente se notificaron en otros países europeos. Los análisis genómicos realizados en muestras europeas demostraron una estrecha relación con SHAV, aunque con características genéticas diferenciadas respecto a las cepas clásicas descritas en África y Japón.⁶,⁷ Hasta el momento se han identificado al menos dos variantes europeas, denominadas Shamonda virus Europe 1 (SHAV-EU1) y Shamonda virus Europe 2 (SHAV-EU2).⁷

La situación epidemiológica continúa evolucionando y la información disponible sobre la distribución, hospedadores, patogenia y repercusión clínica de estos virus en Europa es todavía limitada. Las detecciones realizadas hasta la fecha se han asociado principalmente a ganado bovino, aunque también se han comunicado infecciones en otras especies. La transmisión se considera fundamentalmente vectorial, mediante Culicoides, de forma similar a otros virus del serogrupo Simbu.⁶,⁸ La aparición de este nuevo virus plantea, por tanto, un desafío para la vigilancia epidemiológica y el diagnóstico diferencial de procesos febriles, reproductivos y productivos en rumiantes.

En este contexto, el objetivo del presente artículo es describir las primeras detecciones laboratoriales de virus Shamonda-like en España y revisar sus principales implicaciones epidemiológicas, clínicas y diagnósticas, con especial atención a las herramientas disponibles para su identificación mediante técnicas de diagnóstico molecular.

Se analizaron muestras procedentes de bovinos de aptitud lechera, todos ellos procedentes de explotaciones localizadas en Andalucía. Las muestras positivas fueron analizadas durante la segunda semana de septiembre de 2026 y fueron los primeros resultados positivos de España.

Los animales presentaban una sintomatología clínica similar, caracterizada principalmente por fiebre y diarrea, junto con descenso en la producción lechera. Las muestras fueron remitidas al laboratorio Laboklin España para la investigación de infección por virus Shamonda-like.

Se analizaron muestras de sangre con EDTA o suero. Para cada muestra se registró el tipo de material remitido y el resultado obtenido mediante la técnica de diagnóstico molecular. Las ocho muestras que resultaron positivas correspondieron a bovinos de aptitud lechera procedentes de Andalucía.

Para la extracción automatizada de ácidos nucleicos se utilizaron 200 µl de sangre con EDTA o suero. La extracción se realizó mediante el sistema MagNA Pure 96 (Roche Diagnostics GmbH, Mannheim, Alemania), utilizando el kit comercial MagNA Pure 96 DNA and Viral NA Small Volume Kit (Roche Diagnostics GmbH), siguiendo las instrucciones del fabricante. Los ácidos nucleicos obtenidos fueron eluidos en un volumen final de 100 µl.

Posteriormente, las muestras fueron analizadas mediante el kit comercial AdiaLyo SHLV (Bio-X Diagnostics, Rochefort, Bélgica), siguiendo las instrucciones del fabricante. La amplificación se realizó en un equipo LightCycler^® 96 (Roche Diagnostics GmbH, Mannheim, Alemania).

El ensayo se utilizó como prueba cualitativa, clasificándose las muestras como positivas o negativas. Se consideraron positivas aquellas muestras que presentaron un valor de Cq inferior a 35. En cada tanda de PCR se incluyeron un control positivo y un control negativo para verificar la validez de la reacción (Figura 1).

El kit empleado permite la detección de los dos tipos de virus Shamonda incluidos en el ensayo, denominados EU1 y EU2.

Los resultados obtenidos mediante PCR se clasificaron como positivos o negativos de acuerdo con el punto de corte establecido. En las muestras positivas se registró el valor de Cq obtenido.

Se realizó un análisis descriptivo de los resultados, considerando el número de muestras positivas y sus valores de Cq, así como las características de los animales afectados, incluyendo especie, aptitud productiva, procedencia geográfica y sintomatología clínica.

Se detectó ARN de virus Shamonda-like mediante RT-PCR en ocho muestras analizadas. Todas las muestras positivas presentaron valores de Cq inferiores a 35, establecido como punto de corte para la interpretación positiva del ensayo.

Los valores de Cq obtenidos oscilaron entre 21.3 y 34.9, con una media de 29.9 y una mediana de 29.0. El valor de Cq más bajo correspondió a la muestra 2609M21238 (Cq = 21.3), mientras que el valor más elevado se obtuvo en la muestra 2609M21242 (Cq = 34.9). Los resultados individuales se muestran en la Tabla 1.

En todas las tandas analíticas se incluyeron controles positivos y negativos, obteniéndose resultados válidos para la interpretación de las muestras analizadas.

La detección mediante RT-PCR de virus Shamonda-like en ocho bovinos de aptitud lechera procedentes de Andalucía constituye un hallazgo relevante dentro del contexto de emergencia de este Orthobunyavirus en Europa. Los animales analizados presentaban un cuadro clínico caracterizado principalmente por fiebre y diarrea, compatible con el descrito recientemente en explotaciones bovinas de otros países europeos. En Francia, los primeros casos descritos durante 2026 se asociaron igualmente a episodios de fiebre, diarrea, letargia y una reducción marcada, aunque reversible, de la producción láctea.¹ No obstante, la detección molecular del virus en animales con sintomatología compatible no permite establecer por sí sola una relación causal entre la infección y la totalidad de los signos observados.

La aparición de Shamonda-like en España plantea la cuestión de si se trata de una introducción reciente o si el virus podría haber circulado previamente sin ser identificado. La primera detección europea de esta variante se produjo durante el verano de 2026 y posteriormente se notificaron infecciones en diferentes países de Europa central y occidental.¹,² La rápida expansión geográfica observada durante los primeros meses de vigilancia es compatible con una reciente introducción y posterior dispersión, aunque no permite descartar completamente una circulación previa de baja intensidad o infradiagnosticada. La ausencia de programas específicos de vigilancia anteriores y la similitud clínica con otros procesos infecciosos, metabólicos o relacionados con el estrés dificultan establecer cuándo se produjo realmente la entrada del virus en España.

La distribución de los vectores constituye un elemento fundamental para interpretar esta expansión. Al igual que otros virus del serogrupo Simbu, Shamonda se considera un virus transmitido principalmente por dípteros hematófagos del género Culicoides.² La presencia y actividad estacional de estos vectores en España proporciona un contexto epidemiológico compatible con la circulación de arbovirus, aunque la detección del virus en una región determinada no demuestra por sí misma qué especie de Culicoides está implicada. Será necesario realizar estudios entomológicos y de vigilancia molecular específicos para determinar los vectores competentes y conocer su distribución en las zonas afectadas.

Desde el punto de vista molecular, la relación de Shamonda-like con otros Orthobunyavirus del serogrupo Simbu es especialmente relevante. El virus Schmallenberg comparte características epidemiológicas y determinados elementos genéticos con virus relacionados, pero constituye un agente diferente.¹,³ De hecho, el genoma segmentado de los Orthobunyavirus permite fenómenos de reasortamiento entre segmentos, lo que contribuye a la diversidad genética de este grupo viral.³ En 2026 se han identificado en Europa dos variantes genéticamente diferenciadas, SHAV-EU1 y SHAV-EU2. Los análisis realizados por el Friedrich-Loeffler-Institut indican diferencias entre ambas variantes en los tres segmentos genómicos y sugieren que podrían corresponder a eventos de introducción independientes.⁴

La posible repercusión clínica y reproductiva constituye uno de los principales aspectos que deberán investigarse. Los Orthobunyavirus del serogrupo Simbu pueden producir enfermedad reproductiva y alteraciones congénitas, especialmente cuando la infección tiene lugar durante determinadas fases de la gestación. El virus Akabane y el virus Schmallenberg constituyen ejemplos bien documentados de este fenómeno.⁵ Sin embargo, la evidencia disponible específicamente para la variante Shamonda-like europea todavía es limitada. En Suiza se ha detectado el virus en fetos bovinos abortados y se ha planteado la posibilidad de transmisión transplacentaria, aunque se continúa investigando la relación causal con los abortos.² Por ello, la presencia de infección en animales adultos con sintomatología aguda no debe extrapolarse directamente a un efecto teratógeno, siendo necesarios estudios específicos de vigilancia reproductiva y análisis de fetos, placentas y animales neonatos.

El diagnóstico laboratorial presenta asimismo dificultades relevantes. La detección directa del virus mediante RT-PCR constituye una herramienta fundamental durante la fase aguda, especialmente a partir de sangre con EDTA o suero.² Sin embargo, la viremia de los Orthobunyavirus puede ser de duración limitada, por lo que el momento de obtención de la muestra puede condicionar el resultado.⁶ Esta circunstancia debe tenerse en cuenta cuando se investigan animales con sintomatología compatible, pero resultados moleculares negativos.

La serología puede aportar información adicional para estudios epidemiológicos y de exposición, pero su interpretación resulta más compleja debido a la reactividad cruzada existente entre virus del serogrupo Simbu. Se ha demostrado que la diferenciación serológica entre determinados miembros de este grupo puede resultar problemática, por lo que los resultados positivos mediante técnicas serológicas deben interpretarse con precaución y, cuando sea necesario, confirmarse mediante técnicas específicas como la seroneutralización.⁷ La situación actual en Europa refuerza esta consideración, ya que la circulación simultánea de Schmallenberg y de las dos variantes de Shamonda incrementa la posibilidad de resultados serológicos difíciles de interpretar.⁴

En este contexto, la caracterización molecular mediante secuenciación adquiere especial importancia. Las técnicas de PCR específicas permiten una detección rápida y dirigida, mientras que la secuenciación puede confirmar la identidad del agente, establecer relaciones filogenéticas y diferenciar entre variantes europeas. En la caracterización inicial del virus europeo, la secuenciación completa del genoma permitió demostrar su estrecha relación con Shamonda y evidenció diferencias entre los distintos segmentos genómicos.¹ Por tanto, en aquellos casos en los que la identificación mediante PCR específica no permita una caracterización suficiente, la utilización de PCR genéricas dirigidas frente al serogrupo Simbu seguida de secuenciación puede constituir una estrategia diagnóstica complementaria.

Los resultados obtenidos en el presente trabajo deben interpretarse dentro de estas limitaciones. Lo demostrado directamente en nuestra serie es la detección de ARN de Shamonda-like mediante un ensayo molecular comercial en ocho bovinos de aptitud lechera procedentes de Andalucía, todos ellos con sintomatología compatible. Los valores de Cq obtenidos oscilaron entre 21,3 y 34,9, confirmándose resultados positivos de acuerdo con el punto de corte establecido por el ensayo. Estos resultados constituyen evidencia de infección molecular en los animales analizados, pero no permiten determinar por sí solos la prevalencia de la infección en España, la duración de la viremia, la vía exacta de introducción o el papel del virus como causa única de los signos clínicos.

En conjunto, la detección de Shamonda-like en España amplía la distribución conocida del virus en Europa y pone de manifiesto la necesidad de incorporar este agente al diagnóstico diferencial de determinados cuadros clínicos en bovinos, especialmente cuando se presentan fiebre, diarrea y alteraciones productivas en un contexto epidemiológico compatible. La vigilancia molecular, junto con el seguimiento de los procesos reproductivos y la vigilancia de los vectores, será necesaria para determinar la verdadera distribución del virus, identificar posibles hospedadores y vectores implicados y establecer su impacto clínico y productivo en la ganadería española.

• La detección de ARN de virus Shamonda-like en ocho bovinos de aptitud lechera de Andalucía documenta la presencia de este Orthobunyavirus en España.
• Los animales positivos presentaron un cuadro clínico caracterizado principalmente por fiebre y diarrea, aunque la detección molecular por sí sola no permite establecer una relación causal entre la infección y la sintomatología observada.
• La RT-PCR constituye una herramienta útil para la detección directa de Shamonda-like, siendo necesario considerar el momento de toma de muestras y los valores de Cq para la correcta interpretación de los resultados.
• La incorporación de Shamonda-like al diagnóstico diferencial de procesos compatibles en rumiantes, junto con la vigilancia epidemiológica y entomológica, permitirá mejorar el conocimiento sobre su distribución y repercusión en España.
• Son necesarios estudios adicionales, especialmente de caracterización molecular, vigilancia de Culicoides y seguimiento de casos reproductivos, para determinar la epidemiología, patogenicidad e importancia productiva de este virus en la cabaña ganadera española.

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